Стиль синдо-дзинэн-рю был основан Ясухиро Кониси. Он родился в 1893 году в провинции Кагава и с шести лет стал заниматься дзю-дзюцу стиля мусо-рю. В старших классах он переключился на стиль такэноути-рю. Этот стиль считается жестким, в нем много сильных ударов ногами и руками. Кониси одновременно изучал и кендо, а в 1915 году поступил в токийский университет. Там он стал капитаном университетской команды по кендо.
В Токио Кониси впервые познакомился с окинавским боевым искусством, которое в те времена называлось просто «тэ».
В 1923 году он открыл собственную школу единоборств Рёбукан (зал совершенства воинских искусств). В школе преподавались кендо и дзю-дзюцу.
В 1924 году произошло событие, которое перевернуло жизнь молодого мастера. По рекомендации профессора Касуи в школе Кони- си получили возможность тренироваться Гитин Фунакоси и Хиронори Оцука. По японским традициям, появление в школе мастера, который собирался преподавать другой стиль, было откровенным вызовом хозяину. Но Кониси проявил благоразумие и дальновидность. Он понял, что близкое знакомство с представителями другой школы единоборств только обогатит его собственные представления о боевых искусствах.
Кониси стал идейным последователем Фунакоси и всячески помогал ему при организации школы при университете Кэйо, которая стала первым клубом, где изучалось каратэ.
Ученики школы Ясухиро Кониси получали всесторонние знания. Кроме основательного изучения восточных единоборств, они знакомились и с европейскими стилями борьбы, в частности, с боксом.
Сторонники чистого дзю-дзюцу поначалу не принимали новшеств, и нередко Фунакоси получал вызовы от представителей других школ. По правилам, прежде чем сразиться с учителем, бросившие вызов дрались с его учениками и помощниками. Ни разу сам Фунакоси не участвовал в поединке — все противники были побеждены Кониси и Оцукой.
Кониси был открытым и приветливым человеком. Он с удовольствием общался с мастерами «конкурирующих» стилей. У него в школе побывали знаменитые японские борцы — основатель сито-рю Кэнва Мабуни и основатель годзю-рю Тедзин Мияги. Долгое время Кониси добивался знакомства с Тёки Мотобу, которого считал непревзойденным мастером воинских искусств. Мотобу согласился потренироваться вместе с Кониси.
Общение с этими тремя мастерами помогло Ясухиро Кониси создать свой стиль. Он назвал его синдо-дзинэн-рю, что в переводе означает «естественный стиль божественного пути». Кониси был убежден, что занятие боевыми искусствами помогает расширению кругозора и обогащению человека новыми знаниями и опытом, ведет его по праведному, «божественному» пути.
Ясухиро Кониси был близко знаком с Морихеи Уесибой, основателем айкидо. Они много тренировались вместе. Ясухиро считал Уесибу самым сильным из известных ему бойцов. Под влиянием Уесибы Кониси разработал комплекс упражнений тай-сабаки («движения тела»). Он был основан на технике каратэ, но включал несколько движений, характерных для айкидо. Сами по себе эти движения были не сложны, но трудность заключалась в том, что они выполнялись в быстром темпе, без остановок. Кониси продемонстрировал комплекс Уесибе и получил отг мастера такой комментарий: «То, что ты показал, вполне приемлемо. Это ката действительно мастерское».
В 1935 году высшие чины японской армии обратились к Ясухиро Кониси с просьбой разработать комплекс приемов самозащиты для женщин. Кониси вместе с Кэнвой Мабуни и Уесибой создал формальный комплекс упражнений. Мастер учитывал, что женский организм отличается от мужского, в нем другие чувствительные точки, иная динамика движений. В комплексе применены более высокие стойки, включены особые, «женские» элементы.
После второй мировой войны каратэ было введено в систему общественного образования. До самой смерти в 1983 году Ясухиро Кониси преподавал в коммерческих и педагогических училищах, постоянно обогащая стиль синдо-дзинэн-рю.